John Sheppard

Played by Joe Flanigan

Lt. Colonel John Sheppard ist ein hervorragender Pilot und der führende militärische Offizier der Atlantis-Expedition. Er ist ein gerissener Soldat mit einem recht eigenen Humor und berüchtigtem Golfschwung. Er führt sein Team äußerst gewissenhaft durch alle Missionen. 

Seine Führungsqualität und sein Mut werden durch die ständige Flucht vor den langjährigen Erzfeinden, den Wraith, auf die Probe gestellt. Doch es tauchen noch weitere Feinde auf. Sheppards Talente sind nicht das Einzige, was ihn auszeichnet: Er hat das seltene Antiker-Gen, das es ihm erlaubt, die Technologien der Antiker - den Erbauern der Stargates und Schöpfern von Atlantis - zu aktivieren und zu nutzen.